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les chercheurs ont découvert un sweet spot pour le coronavirus!

Les protéines virales S interagissent avec un récepteur cellulaire pour permettre au SRAS-CoV-2 d’entrer dans nos cellules. Cependant, des chercheurs américains ont mis au jour une zone de cette protéine qui est source d’espoir. En le modifiant, il serait possible de réduire l’intensité des interactions.

Agir sur une autre zone de la protéine S.

Depuis l’apparition du coronavirus SRAS-CoV-2, la protéine S (surface) a certainement été l’élément le plus étudié de sa structure. Cette protéine il se lie à l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2), un récepteur qui permet au coronavirus d’entrer dans une cellule hôte. Cependant, la protéine S contient une zone particulière, le site de liaison au récepteur (RBD). Cela correspond à la fin de la protéine directement en contact avec le récepteur ACE2.

Dans une étude publiée dans la revue ACS Nano le 2 août 2020, des chercheurs de la Northwestern University (États-Unis) affirment avoir identifié un autre domaine intéressant de la protéine S. Ceci est très proche de la zone RBD (10 nanomètres). Selon les responsables de l’étude, si cette nouvelle zone est modifiée, la liaison RBD-ACE2 pourrait être affaiblie.

Crédit: Université Northwestern / ACS Nano

Des résultats prometteurs

Les chercheurs évoquent un site de clivage polybasique, composé de trois arginines et d’une alanine qui lui confèrent une charge positive globale pour une enzyme appelée “furine”. Cependant, ce clivage est nécessaire pour l’activation de la fusion de l’enveloppe virale avec la membrane de la cellule hôte. Par conséquent, les scientifiques ont comparé le lien RBD-ACE2 par rapport à la protéine de base S avec deux mutants dont la coupe polybasique a été modifiée. Dans le cas du premier mutant, les scientifiques ont retiré les acides aminés du site polybasique. Pour le second, il s’agit de remplacer deux de ces acides aminés.

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Les résultats montrent une réduction des interactions RBD-ACE2 36% concernant le premier mutant et 20% par seconde. Cela nous a permis de comprendre que modifier une partie de la protéine S en dehors de la RBD nous permet également d’influencer la capacité de la protéine à infecter nos cellules! Compte tenu de la qualité des résultats obtenus par les chercheurs, ils le croient adresser ce site polybasique thérapeutiquement. Les scientifiques ont également synthétisé un petit peptide composé de quatre acides aminés chargés négativement. Les résultats sont prometteurs car il s’agit de 41% de réduction des liaisons hydrogène. Par conséquent, cela ouvre la voie à un traitement qui affaiblit la liaison RBD-ACE2.

Cependant, vous devez savoir que pour le moment, cette recherche reste théorique. En fait, aucun test n’a été réalisé in vitro. Les chercheurs n’en sont qu’au stade de supposer que l’affaiblissement des interactions entre la RBD et l’ACE2 peut diminuer l’infectivité du coronavirus.

Cunégonde Lestrange

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